Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED6P86452 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms