Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms