Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB38P57729 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms