Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD4P55036 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms