Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAB5CP51148 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAB5CP51148 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB5CP51148 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAB5CP51148 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB5CP51148 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5CP51148 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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