Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms