Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms