Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARRB1P49407 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARRB1P49407 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms