Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAEP38570 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms