Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms