Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM23P36406 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM23P36406 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms