Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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