Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPHA2P29317 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms