Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSFA2P28290 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSFA2P28290 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms