Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PLNP26678 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms