Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms