Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF3P18847 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF3P18847 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF3P18847 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms