Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPIP17213 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPIP17213 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPIP17213 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPIP17213 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIP17213 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIP17213 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIP17213 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIP17213 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIP17213 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BPIP17213 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms