Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD46P15529 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms