Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms