Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH1P12830 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDH1P12830 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH1P12830 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH1P12830 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH1P12830 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms