Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2AP11388 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC29.08■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2AP11388 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms