Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GLI4P10075 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GLI4P10075 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GLI4P10075 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms