Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRMUO75648 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRMUO75648 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRMUO75648 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRMUO75648 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms