Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ1O43426 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ1O43426 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms