Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLGNO14967 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLGNO14967 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLGNO14967 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLGNO14967 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms