Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H3BNH8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H3BNH8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3BNH8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms