Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C9orf92A6NGG3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
C9orf92A6NGG3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms