Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT87PA6NCN2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms