Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD54BQ9Y620 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD54BQ9Y620 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms