Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.9 ms