Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED16Q9Y2X0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms