Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRPF3Q9ULD4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms