Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRIP3Q9NQ35 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms