Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms