Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTN4Q9HB63 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms