Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ROPN1BQ9BZX4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms