Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SSBP4Q9BWG4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms