Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CENPOQ9BU64 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms