Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms