Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TEFMQ96QE5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms