Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C9orf85Q96MD7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms