Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPZA3Q96KX2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms