Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A2Q96JW4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC41A2Q96JW4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms