Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMD3Q96D46 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms