Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms