Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms