Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms