Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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