Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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SETD9Q8NE22 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SETD9Q8NE22 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SETD9Q8NE22 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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